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図は血球分化の過程で重要な転写因子を阻害したときのシミュレーション結果を示します。

複雑な遺伝子ネットワークモデルを予測シミュレーターとして活用することで細胞運命制御における遺伝子機能の直観的な解釈を可能にします。

Kamimoto, K., et al., 

Dissecting cell identity via network inference and in silico gene perturbation. 

Nature 614, 742–751 (2023). 

１細胞RNA-seqデータから作成した細胞特異的な遺伝子制御のモデルを構築し、そのモデルを利用したシミュレーションにより細胞のリプログラミングに重要な遺伝子を計算机上で探索する、in silico screening解析を行いました。

本研究は生物データを統合して作成したモデルを利用して細胞設計・生命工学研究を行うという戦略の概念実証の一つです。

Kamimoto, K., et al.,

Gene regulatory network reconfigulation in direct lineage reprogramming.

Stem cell reports 18, 97-112 (2023).